GENETIC DIVERSITY IN THREE ALBANIAN LOCAL GOAT BREEDS ASSESSED BY 10 MICROSATELLITE MARKERS

HYKAJ, GENTJAN; HODA, ANILA

AKTET - Journal of Institute Alb-Shkenca
AKTET, Volume 4, Issue 1, Biologji, Biokimi (Njeriut, Bime, Kafshe), 2011

Title: GENETIC DIVERSITY IN THREE ALBANIAN LOCAL GOAT BREEDS ASSESSED BY 10 MICROSATELLITE MARKERS

Titulli shqip: STUDIMI I DIVERSITETIT GJENETIK Të TRE RACAVE AUTOKTONE Të DHIVE ME ANë Të 10 MARKERëVE MIKROSATELITë

Abstract: Goats are an important livestock species in Albania. A total of 93 individuals, representative of thre local goat breeds: "Capore", "Muzhake" and "Liqenasi" were gentoyped for 10 microsatellite markers. A total number of 102 alleles were identified. Allelic richness was 8.623 and a total of 22 private alleles were found. There is a significant deficit of heterozygotes 7.1% (p≤0.001), for the analyzed breeds. The data reveal a moderate level of genetic differentiation. Based on multilocus FST value, 2% of genetic variation is because of breed differences and 98% corespond to differences between individuals. Nei's genetic diversity HT was 0.8. Genetic distances between breeds were small.Gene flow was high, 12.18, and might have contributed in the uniformity between breeds. Genetic drift have contributed in genetic differrentiation between breeds.

Abstrakti: Dhitë konsiderohen një nga speciet e kafshëve bujqësore me shumë rëndësi në Shqipëri. Kampioni prej 93 individësh të 3 racave lokale: "Capore", "Muzhake" dhe "Liqenasi" është gjenotipizuar për 10 markerë mikrosatelitë. Numri i aleleve për 10 lokuset është 102. Pasuria alelike ka vlerën mesatare 8.623. Numri i alelve private është 22. Ekziston një defiçit sinjifikant i heterozigotëve prej 7.1% (p≤0.001) për secilën nga racat. Ky defiçit është në masën 8.9% (p≤0.001) për të gjithë popullatën. Vlerat FST tregojnë se 2% e variacionit gjenetik total shpjegohen me diferencat midis racave dhe 98% nga ndryshimet midis individëve. Diversiteti gjenetik HT rezulton 0.8, ndërsa vlera GST 0.008. Dallohet distancë e vogël gjenetike midis racave dhe fluks i madh i gjeneve, 12.18. Fluksi i gjeneve mund të ketë luajtur një rol të rëndësishëm në uniformitetin gjenetik të popullatave. Drifti i gjeneve është faktor i rëndësishëm në diferencimin gjenetik midis racave.

Key words: genetic distances, breeds, goat, microsatellite, gene flow.

Fjalë kyçe: distancë gjenetike, raca, dhi, mikrosatelit, fluks gjenesh

Corresponding author: GENTJAN HYKAJ (gentianhyka@yahoo.com)

Authors: GENTJAN HYKAJ, Gjimnazi "Asim Zeneli", Gjikrokastër, Albania
ANILA HODA, Universiteti Bujqesor, Kamez, Tiranë, Albania

Full text: Download Issue 1 [PDF]

	AKTET Journal of Institute Alb-Shkenca Revistë Shkencore e Institutit Alb-Shkenca ( ISSN 2073-2244 )
(english)

Title:	GENETIC DIVERSITY IN THREE ALBANIAN LOCAL GOAT BREEDS ASSESSED BY 10 MICROSATELLITE MARKERS
Titulli shqip:	STUDIMI I DIVERSITETIT GJENETIK Të TRE RACAVE AUTOKTONE Të DHIVE ME ANë Të 10 MARKERëVE MIKROSATELITë
Abstract:	Goats are an important livestock species in Albania. A total of 93 individuals, representative of thre local goat breeds: "Capore", "Muzhake" and "Liqenasi" were gentoyped for 10 microsatellite markers. A total number of 102 alleles were identified. Allelic richness was 8.623 and a total of 22 private alleles were found. There is a significant deficit of heterozygotes 7.1% (p≤0.001), for the analyzed breeds. The data reveal a moderate level of genetic differentiation. Based on multilocus FST value, 2% of genetic variation is because of breed differences and 98% corespond to differences between individuals. Nei's genetic diversity HT was 0.8. Genetic distances between breeds were small.Gene flow was high, 12.18, and might have contributed in the uniformity between breeds. Genetic drift have contributed in genetic differrentiation between breeds.
Abstrakti:	Dhitë konsiderohen një nga speciet e kafshëve bujqësore me shumë rëndësi në Shqipëri. Kampioni prej 93 individësh të 3 racave lokale: "Capore", "Muzhake" dhe "Liqenasi" është gjenotipizuar për 10 markerë mikrosatelitë. Numri i aleleve për 10 lokuset është 102. Pasuria alelike ka vlerën mesatare 8.623. Numri i alelve private është 22. Ekziston një defiçit sinjifikant i heterozigotëve prej 7.1% (p≤0.001) për secilën nga racat. Ky defiçit është në masën 8.9% (p≤0.001) për të gjithë popullatën. Vlerat FST tregojnë se 2% e variacionit gjenetik total shpjegohen me diferencat midis racave dhe 98% nga ndryshimet midis individëve. Diversiteti gjenetik HT rezulton 0.8, ndërsa vlera GST 0.008. Dallohet distancë e vogël gjenetike midis racave dhe fluks i madh i gjeneve, 12.18. Fluksi i gjeneve mund të ketë luajtur një rol të rëndësishëm në uniformitetin gjenetik të popullatave. Drifti i gjeneve është faktor i rëndësishëm në diferencimin gjenetik midis racave.
Key words:	genetic distances, breeds, goat, microsatellite, gene flow.
Fjalë kyçe:	distancë gjenetike, raca, dhi, mikrosatelit, fluks gjenesh
Corresponding author:	GENTJAN HYKAJ (gentianhyka@yahoo.com)
Authors:	GENTJAN HYKAJ, Gjimnazi "Asim Zeneli", Gjikrokastër, Albania ANILA HODA, Universiteti Bujqesor, Kamez, Tiranë, Albania
Full text:	Download Issue 1 [PDF]